Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Spc24Q9D083 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spc24Q9D083 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spc24Q9D083 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spc24Q9D083 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spc24Q9D083 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms