Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf146Q9CZW6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf146Q9CZW6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf146Q9CZW6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf146Q9CZW6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf146Q9CZW6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf146Q9CZW6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf146Q9CZW6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf146Q9CZW6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf146Q9CZW6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf146Q9CZW6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf146Q9CZW6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf146Q9CZW6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf146Q9CZW6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf146Q9CZW6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf146Q9CZW6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf146Q9CZW6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf146Q9CZW6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms