Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmss1Q9CZT6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cmss1Q9CZT6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmss1Q9CZT6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmss1Q9CZT6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms