Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr3eQ9CZT4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr3eQ9CZT4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr3eQ9CZT4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr3eQ9CZT4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr3eQ9CZT4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr3eQ9CZT4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr3eQ9CZT4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr3eQ9CZT4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr3eQ9CZT4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr3eQ9CZT4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr3eQ9CZT4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr3eQ9CZT4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr3eQ9CZT4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr3eQ9CZT4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr3eQ9CZT4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr3eQ9CZT4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr3eQ9CZT4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Polr3eQ9CZT4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr3eQ9CZT4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Polr3eQ9CZT4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr3eQ9CZT4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr3eQ9CZT4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr3eQ9CZT4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr3eQ9CZT4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr3eQ9CZT4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr3eQ9CZT4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr3eQ9CZT4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr3eQ9CZT4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr3eQ9CZT4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr3eQ9CZT4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr3eQ9CZT4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr3eQ9CZT4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Polr3eQ9CZT4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Polr3eQ9CZT4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Polr3eQ9CZT4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr3eQ9CZT4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr3eQ9CZT4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr3eQ9CZT4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Polr3eQ9CZT4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms