Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thumpd2Q9CZB3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thumpd2Q9CZB3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thumpd2Q9CZB3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Thumpd2Q9CZB3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Thumpd2Q9CZB3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Thumpd2Q9CZB3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Thumpd2Q9CZB3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thumpd2Q9CZB3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thumpd2Q9CZB3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thumpd2Q9CZB3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Thumpd2Q9CZB3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Thumpd2Q9CZB3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Thumpd2Q9CZB3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Thumpd2Q9CZB3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Thumpd2Q9CZB3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Thumpd2Q9CZB3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Thumpd2Q9CZB3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Thumpd2Q9CZB3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Thumpd2Q9CZB3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Thumpd2Q9CZB3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms