Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB0

Sdhc, Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhcQ9CZB0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SdhcQ9CZB0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SdhcQ9CZB0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SdhcQ9CZB0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SdhcQ9CZB0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SdhcQ9CZB0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SdhcQ9CZB0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SdhcQ9CZB0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SdhcQ9CZB0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SdhcQ9CZB0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SdhcQ9CZB0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SdhcQ9CZB0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SdhcQ9CZB0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SdhcQ9CZB0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms