Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx7Q9CY18 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx7Q9CY18 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx7Q9CY18 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Snx7Q9CY18 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx7Q9CY18 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx7Q9CY18 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 365.7 ms