Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXJ1

Ears2, Probable glutamate--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ears2Q9CXJ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ears2Q9CXJ1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ears2Q9CXJ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ears2Q9CXJ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ears2Q9CXJ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ears2Q9CXJ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ears2Q9CXJ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ears2Q9CXJ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ears2Q9CXJ1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ears2Q9CXJ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ears2Q9CXJ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ears2Q9CXJ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ears2Q9CXJ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ears2Q9CXJ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ears2Q9CXJ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ears2Q9CXJ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ears2Q9CXJ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ears2Q9CXJ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ears2Q9CXJ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ears2Q9CXJ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ears2Q9CXJ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ears2Q9CXJ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ears2Q9CXJ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ears2Q9CXJ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ears2Q9CXJ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ears2Q9CXJ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ears2Q9CXJ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ears2Q9CXJ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ears2Q9CXJ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ears2Q9CXJ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ears2Q9CXJ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ears2Q9CXJ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ears2Q9CXJ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ears2Q9CXJ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ears2Q9CXJ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ears2Q9CXJ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ears2Q9CXJ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ears2Q9CXJ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ears2Q9CXJ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ears2Q9CXJ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ears2Q9CXJ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms