Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm5Q9CXE0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm5Q9CXE0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm5Q9CXE0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm5Q9CXE0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm5Q9CXE0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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