Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc17Q9CXD9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc17Q9CXD9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc17Q9CXD9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc17Q9CXD9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc17Q9CXD9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc17Q9CXD9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc17Q9CXD9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc17Q9CXD9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc17Q9CXD9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc17Q9CXD9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc17Q9CXD9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc17Q9CXD9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc17Q9CXD9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc17Q9CXD9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc17Q9CXD9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc17Q9CXD9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc17Q9CXD9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms