Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pin4Q9CWW6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pin4Q9CWW6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pin4Q9CWW6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pin4Q9CWW6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pin4Q9CWW6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pin4Q9CWW6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pin4Q9CWW6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pin4Q9CWW6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pin4Q9CWW6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pin4Q9CWW6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pin4Q9CWW6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pin4Q9CWW6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pin4Q9CWW6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pin4Q9CWW6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pin4Q9CWW6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pin4Q9CWW6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pin4Q9CWW6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pin4Q9CWW6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Pin4Q9CWW6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Pin4Q9CWW6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pin4Q9CWW6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pin4Q9CWW6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pin4Q9CWW6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pin4Q9CWW6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pin4Q9CWW6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pin4Q9CWW6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pin4Q9CWW6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms