Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Snw1Q9CSN1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snw1Q9CSN1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snw1Q9CSN1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snw1Q9CSN1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snw1Q9CSN1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snw1Q9CSN1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Snw1Q9CSN1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snw1Q9CSN1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snw1Q9CSN1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snw1Q9CSN1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snw1Q9CSN1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snw1Q9CSN1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snw1Q9CSN1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snw1Q9CSN1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snw1Q9CSN1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snw1Q9CSN1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snw1Q9CSN1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snw1Q9CSN1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snw1Q9CSN1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snw1Q9CSN1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snw1Q9CSN1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snw1Q9CSN1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snw1Q9CSN1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snw1Q9CSN1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snw1Q9CSN1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snw1Q9CSN1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snw1Q9CSN1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snw1Q9CSN1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snw1Q9CSN1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snw1Q9CSN1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snw1Q9CSN1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snw1Q9CSN1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snw1Q9CSN1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Snw1Q9CSN1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snw1Q9CSN1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.2 ms