Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CRC3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CRC3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CRC3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CRC3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CRC3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CRC3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CRC3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CRC3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CRC3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CRC3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CRC3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CRC3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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