Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gadd45gip1Q9CR59 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gadd45gip1Q9CR59 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gadd45gip1Q9CR59 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gadd45gip1Q9CR59 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gadd45gip1Q9CR59 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gadd45gip1Q9CR59 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gadd45gip1Q9CR59 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gadd45gip1Q9CR59 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gadd45gip1Q9CR59 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gadd45gip1Q9CR59 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gadd45gip1Q9CR59 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gadd45gip1Q9CR59 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gadd45gip1Q9CR59 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gadd45gip1Q9CR59 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gadd45gip1Q9CR59 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gadd45gip1Q9CR59 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gadd45gip1Q9CR59 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gadd45gip1Q9CR59 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gadd45gip1Q9CR59 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gadd45gip1Q9CR59 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gadd45gip1Q9CR59 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms