Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23,47■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23,47■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,46■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Ska2Q9CR46 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Ska2Q9CR46 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Ska2Q9CR46 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ska2Q9CR46 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ska2Q9CR46 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ska2Q9CR46 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ska2Q9CR46 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ska2Q9CR46 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Ska2Q9CR46 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Ska2Q9CR46 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ska2Q9CR46 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ska2Q9CR46 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ska2Q9CR46 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Ska2Q9CR46 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Ska2Q9CR46 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Ska2Q9CR46 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Ska2Q9CR46 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Ska2Q9CR46 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ska2Q9CR46 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23,36■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23,35■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,33■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23,33■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Ska2Q9CR46 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23,33■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23,28■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Ska2Q9CR46 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,27■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23,25■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23,24■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23,23■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23,23■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Ska2Q9CR46 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23,2■■□□□ 1,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33,5 ms