Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR21

Ndufab1, Acyl carrier protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufab1Q9CR21 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ndufab1Q9CR21 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufab1Q9CR21 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufab1Q9CR21 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ndufab1Q9CR21 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufab1Q9CR21 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufab1Q9CR21 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufab1Q9CR21 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufab1Q9CR21 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufab1Q9CR21 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms