Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chchd5Q9CQP3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chchd5Q9CQP3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chchd5Q9CQP3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chchd5Q9CQP3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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