Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncbp2Q9CQ49 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncbp2Q9CQ49 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncbp2Q9CQ49 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncbp2Q9CQ49 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncbp2Q9CQ49 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncbp2Q9CQ49 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncbp2Q9CQ49 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncbp2Q9CQ49 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncbp2Q9CQ49 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncbp2Q9CQ49 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ncbp2Q9CQ49 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ncbp2Q9CQ49 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ncbp2Q9CQ49 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms