Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pole4Q9CQ36 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pole4Q9CQ36 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pole4Q9CQ36 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pole4Q9CQ36 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms