Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
StambpQ9CQ26 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
StambpQ9CQ26 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
StambpQ9CQ26 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
StambpQ9CQ26 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
StambpQ9CQ26 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
StambpQ9CQ26 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
StambpQ9CQ26 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
StambpQ9CQ26 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms