Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mid1ip1Q9CQ20 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mid1ip1Q9CQ20 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mid1ip1Q9CQ20 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mid1ip1Q9CQ20 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mid1ip1Q9CQ20 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mid1ip1Q9CQ20 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mid1ip1Q9CQ20 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mid1ip1Q9CQ20 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mid1ip1Q9CQ20 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Mid1ip1Q9CQ20 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mid1ip1Q9CQ20 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mid1ip1Q9CQ20 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mid1ip1Q9CQ20 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms