Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc18Q9CQ07 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc18Q9CQ07 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc18Q9CQ07 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc18Q9CQ07 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms