Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms