Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Bap1Q99PU7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bap1Q99PU7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Bap1Q99PU7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Bap1Q99PU7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Bap1Q99PU7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bap1Q99PU7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bap1Q99PU7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms