Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU5

Acsbg1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, mousemouse

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsbg1Q99PU5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Acsbg1Q99PU5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Acsbg1Q99PU5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Acsbg1Q99PU5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Acsbg1Q99PU5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Acsbg1Q99PU5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Acsbg1Q99PU5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Acsbg1Q99PU5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms