Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ino80bQ99PT3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ino80bQ99PT3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ino80bQ99PT3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ino80bQ99PT3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ino80bQ99PT3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ino80bQ99PT3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ino80bQ99PT3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ino80bQ99PT3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ino80bQ99PT3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ino80bQ99PT3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms