Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trem2Q99NH8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trem2Q99NH8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trem2Q99NH8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trem2Q99NH8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trem2Q99NH8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trem2Q99NH8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trem2Q99NH8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trem2Q99NH8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trem2Q99NH8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trem2Q99NH8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trem2Q99NH8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trem2Q99NH8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trem2Q99NH8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trem2Q99NH8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trem2Q99NH8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trem2Q99NH8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trem2Q99NH8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trem2Q99NH8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trem2Q99NH8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trem2Q99NH8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trem2Q99NH8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trem2Q99NH8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trem2Q99NH8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trem2Q99NH8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trem2Q99NH8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trem2Q99NH8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trem2Q99NH8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trem2Q99NH8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trem2Q99NH8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trem2Q99NH8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trem2Q99NH8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trem2Q99NH8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trem2Q99NH8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trem2Q99NH8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trem2Q99NH8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trem2Q99NH8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trem2Q99NH8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trem2Q99NH8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trem2Q99NH8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trem2Q99NH8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trem2Q99NH8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trem2Q99NH8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trem2Q99NH8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trem2Q99NH8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trem2Q99NH8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trem2Q99NH8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trem2Q99NH8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trem2Q99NH8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms