Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
Rad54l2Q99NG0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
Rad54l2Q99NG0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Rad54l2Q99NG0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Rad54l2Q99NG0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Rad54l2Q99NG0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Rad54l2Q99NG0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rad54l2Q99NG0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rad54l2Q99NG0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rad54l2Q99NG0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Rad54l2Q99NG0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Rad54l2Q99NG0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Rad54l2Q99NG0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Rad54l2Q99NG0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Rad54l2Q99NG0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Rad54l2Q99NG0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Rad54l2Q99NG0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rad54l2Q99NG0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rad54l2Q99NG0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Rad54l2Q99NG0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Rad54l2Q99NG0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rad54l2Q99NG0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rad54l2Q99NG0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Rad54l2Q99NG0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rad54l2Q99NG0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Rad54l2Q99NG0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Rad54l2Q99NG0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rad54l2Q99NG0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rad54l2Q99NG0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rad54l2Q99NG0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rad54l2Q99NG0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rad54l2Q99NG0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rad54l2Q99NG0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rad54l2Q99NG0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rad54l2Q99NG0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rad54l2Q99NG0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rad54l2Q99NG0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rad54l2Q99NG0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rad54l2Q99NG0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rad54l2Q99NG0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rad54l2Q99NG0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rad54l2Q99NG0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rad54l2Q99NG0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rad54l2Q99NG0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rad54l2Q99NG0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rad54l2Q99NG0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Rad54l2Q99NG0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rad54l2Q99NG0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rad54l2Q99NG0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rad54l2Q99NG0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rad54l2Q99NG0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rad54l2Q99NG0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Rad54l2Q99NG0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Rad54l2Q99NG0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rad54l2Q99NG0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rad54l2Q99NG0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rad54l2Q99NG0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Rad54l2Q99NG0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Rad54l2Q99NG0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Rad54l2Q99NG0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Rad54l2Q99NG0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Rad54l2Q99NG0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Rad54l2Q99NG0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Rad54l2Q99NG0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rad54l2Q99NG0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rad54l2Q99NG0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rad54l2Q99NG0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rad54l2Q99NG0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rad54l2Q99NG0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rad54l2Q99NG0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rad54l2Q99NG0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rad54l2Q99NG0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Rad54l2Q99NG0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Rad54l2Q99NG0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Rad54l2Q99NG0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Rad54l2Q99NG0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Rad54l2Q99NG0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
Rad54l2Q99NG0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Rad54l2Q99NG0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Rad54l2Q99NG0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Rad54l2Q99NG0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Rad54l2Q99NG0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Rad54l2Q99NG0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rad54l2Q99NG0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rad54l2Q99NG0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rad54l2Q99NG0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Rad54l2Q99NG0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Rad54l2Q99NG0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Rad54l2Q99NG0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Rad54l2Q99NG0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Rad54l2Q99NG0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Rad54l2Q99NG0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rad54l2Q99NG0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rad54l2Q99NG0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rad54l2Q99NG0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Rad54l2Q99NG0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms