Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atoh8Q99NA2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Atoh8Q99NA2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atoh8Q99NA2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atoh8Q99NA2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atoh8Q99NA2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atoh8Q99NA2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atoh8Q99NA2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atoh8Q99NA2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Atoh8Q99NA2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atoh8Q99NA2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atoh8Q99NA2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atoh8Q99NA2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atoh8Q99NA2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atoh8Q99NA2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atoh8Q99NA2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atoh8Q99NA2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atoh8Q99NA2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atoh8Q99NA2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atoh8Q99NA2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atoh8Q99NA2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atoh8Q99NA2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atoh8Q99NA2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atoh8Q99NA2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atoh8Q99NA2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atoh8Q99NA2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atoh8Q99NA2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atoh8Q99NA2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atoh8Q99NA2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226.9 ms