Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl1Q99N96 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl1Q99N96 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl1Q99N96 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl1Q99N96 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl1Q99N96 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl1Q99N96 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl1Q99N96 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl1Q99N96 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl1Q99N96 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl1Q99N96 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl1Q99N96 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl1Q99N96 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl1Q99N96 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl1Q99N96 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl1Q99N96 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl1Q99N96 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrpl1Q99N96 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl1Q99N96 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl1Q99N96 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl1Q99N96 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl1Q99N96 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl1Q99N96 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl1Q99N96 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl1Q99N96 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl1Q99N96 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms