Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac9Q99N13 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdac9Q99N13 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdac9Q99N13 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hdac9Q99N13 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac9Q99N13 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Hdac9Q99N13 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hdac9Q99N13 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Hdac9Q99N13 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hdac9Q99N13 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac9Q99N13 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac9Q99N13 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac9Q99N13 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac9Q99N13 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac9Q99N13 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac9Q99N13 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac9Q99N13 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac9Q99N13 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac9Q99N13 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac9Q99N13 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Hdac9Q99N13 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hdac9Q99N13 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdac9Q99N13 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hdac9Q99N13 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdac9Q99N13 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdac9Q99N13 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdac9Q99N13 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hdac9Q99N13 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hdac9Q99N13 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hdac9Q99N13 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hdac9Q99N13 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hdac9Q99N13 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hdac9Q99N13 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hdac9Q99N13 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdac9Q99N13 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdac9Q99N13 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac9Q99N13 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Hdac9Q99N13 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hdac9Q99N13 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hdac9Q99N13 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hdac9Q99N13 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac9Q99N13 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac9Q99N13 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac9Q99N13 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac9Q99N13 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms