Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ms4a4dQ99N05 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ms4a4dQ99N05 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ms4a4dQ99N05 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ms4a4dQ99N05 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ms4a4dQ99N05 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ms4a4dQ99N05 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ms4a4dQ99N05 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ms4a4dQ99N05 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ms4a4dQ99N05 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ms4a4dQ99N05 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ms4a4dQ99N05 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ms4a4dQ99N05 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ms4a4dQ99N05 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ms4a4dQ99N05 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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