Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pramel1Q99MW3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pramel1Q99MW3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pramel1Q99MW3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pramel1Q99MW3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pramel1Q99MW3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pramel1Q99MW3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pramel1Q99MW3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pramel1Q99MW3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pramel1Q99MW3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pramel1Q99MW3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pramel1Q99MW3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pramel1Q99MW3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pramel1Q99MW3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pramel1Q99MW3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pramel1Q99MW3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pramel1Q99MW3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pramel1Q99MW3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pramel1Q99MW3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pramel1Q99MW3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pramel1Q99MW3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pramel1Q99MW3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pramel1Q99MW3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pramel1Q99MW3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pramel1Q99MW3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pramel1Q99MW3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pramel1Q99MW3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pramel1Q99MW3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pramel1Q99MW3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pramel1Q99MW3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pramel1Q99MW3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pramel1Q99MW3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pramel1Q99MW3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pramel1Q99MW3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pramel1Q99MW3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pramel1Q99MW3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pramel1Q99MW3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pramel1Q99MW3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pramel1Q99MW3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pramel1Q99MW3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pramel1Q99MW3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pramel1Q99MW3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pramel1Q99MW3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pramel1Q99MW3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pramel1Q99MW3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramel1Q99MW3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramel1Q99MW3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramel1Q99MW3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pramel1Q99MW3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pramel1Q99MW3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms