Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PccbQ99MN9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PccbQ99MN9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PccbQ99MN9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PccbQ99MN9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PccbQ99MN9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PccbQ99MN9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PccbQ99MN9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PccbQ99MN9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PccbQ99MN9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PccbQ99MN9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PccbQ99MN9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PccbQ99MN9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PccbQ99MN9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PccbQ99MN9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PccbQ99MN9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PccbQ99MN9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PccbQ99MN9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PccbQ99MN9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms