Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clcc1Q99LI2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcc1Q99LI2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcc1Q99LI2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcc1Q99LI2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcc1Q99LI2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcc1Q99LI2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcc1Q99LI2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcc1Q99LI2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcc1Q99LI2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcc1Q99LI2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcc1Q99LI2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcc1Q99LI2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcc1Q99LI2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcc1Q99LI2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcc1Q99LI2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcc1Q99LI2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcc1Q99LI2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcc1Q99LI2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcc1Q99LI2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcc1Q99LI2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms