Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q99KU6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q99KU6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q99KU6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q99KU6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q99KU6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q99KU6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q99KU6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q99KU6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q99KU6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q99KU6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q99KU6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q99KU6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q99KU6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q99KU6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q99KU6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q99KU6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q99KU6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q99KU6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q99KU6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q99KU6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q99KU6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q99KU6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q99KU6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q99KU6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q99KU6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q99KU6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q99KU6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q99KU6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q99KU6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q99KU6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q99KU6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q99KU6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q99KU6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Q99KU6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q99KU6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q99KU6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q99KU6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q99KU6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q99KU6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q99KU6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q99KU6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q99KU6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q99KU6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q99KU6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Q99KU6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q99KU6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q99KU6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q99KU6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q99KU6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q99KU6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q99KU6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q99KU6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q99KU6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q99KU6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q99KU6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q99KU6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q99KU6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q99KU6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q99KU6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q99KU6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q99KU6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q99KU6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q99KU6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q99KU6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q99KU6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q99KU6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q99KU6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q99KU6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q99KU6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q99KU6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q99KU6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q99KU6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q99KU6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Q99KU6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q99KU6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q99KU6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Q99KU6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q99KU6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q99KU6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q99KU6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q99KU6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q99KU6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q99KU6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q99KU6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q99KU6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q99KU6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Q99KU6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q99KU6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q99KU6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q99KU6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q99KU6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q99KU6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q99KU6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q99KU6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q99KU6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q99KU6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q99KU6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q99KU6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q99KU6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms