Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SmagpQ99KC7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SmagpQ99KC7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SmagpQ99KC7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms