Protein–RNA interactions for Protein: Q99J25

Mrm1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrm1Q99J25 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrm1Q99J25 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrm1Q99J25 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrm1Q99J25 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrm1Q99J25 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrm1Q99J25 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrm1Q99J25 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrm1Q99J25 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrm1Q99J25 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrm1Q99J25 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrm1Q99J25 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrm1Q99J25 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrm1Q99J25 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrm1Q99J25 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrm1Q99J25 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrm1Q99J25 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrm1Q99J25 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrm1Q99J25 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms