Protein–RNA interactions for Protein: Q925J9

Med1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med1Q925J9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Med1Q925J9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Med1Q925J9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Med1Q925J9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Med1Q925J9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Med1Q925J9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Med1Q925J9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Med1Q925J9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Med1Q925J9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Med1Q925J9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Med1Q925J9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Med1Q925J9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
Med1Q925J9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Med1Q925J9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Med1Q925J9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Med1Q925J9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Med1Q925J9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Med1Q925J9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Med1Q925J9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Med1Q925J9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Med1Q925J9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Med1Q925J9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Med1Q925J9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Med1Q925J9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Med1Q925J9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Med1Q925J9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Med1Q925J9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Med1Q925J9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Med1Q925J9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Med1Q925J9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Med1Q925J9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Med1Q925J9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Med1Q925J9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Med1Q925J9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Med1Q925J9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Med1Q925J9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Med1Q925J9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Med1Q925J9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Med1Q925J9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Med1Q925J9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Med1Q925J9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Med1Q925J9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Med1Q925J9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Med1Q925J9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Med1Q925J9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Med1Q925J9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Med1Q925J9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Med1Q925J9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Med1Q925J9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Med1Q925J9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Med1Q925J9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Med1Q925J9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Med1Q925J9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Med1Q925J9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Med1Q925J9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Med1Q925J9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Med1Q925J9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Med1Q925J9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Med1Q925J9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Med1Q925J9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Med1Q925J9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Med1Q925J9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms