Protein–RNA interactions for Protein: Q925E0

Sntg2, Gamma-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg2Q925E0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sntg2Q925E0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sntg2Q925E0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sntg2Q925E0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sntg2Q925E0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sntg2Q925E0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sntg2Q925E0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sntg2Q925E0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sntg2Q925E0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sntg2Q925E0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sntg2Q925E0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sntg2Q925E0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sntg2Q925E0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sntg2Q925E0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sntg2Q925E0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sntg2Q925E0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sntg2Q925E0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sntg2Q925E0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sntg2Q925E0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sntg2Q925E0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sntg2Q925E0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sntg2Q925E0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sntg2Q925E0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sntg2Q925E0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sntg2Q925E0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sntg2Q925E0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sntg2Q925E0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms