Protein–RNA interactions for Protein: Q924X2

Cpt1b, Carnitine O-palmitoyltransferase 1, muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpt1bQ924X2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpt1bQ924X2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpt1bQ924X2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpt1bQ924X2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpt1bQ924X2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpt1bQ924X2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpt1bQ924X2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpt1bQ924X2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpt1bQ924X2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpt1bQ924X2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpt1bQ924X2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpt1bQ924X2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpt1bQ924X2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpt1bQ924X2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpt1bQ924X2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpt1bQ924X2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpt1bQ924X2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpt1bQ924X2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpt1bQ924X2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpt1bQ924X2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpt1bQ924X2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpt1bQ924X2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpt1bQ924X2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpt1bQ924X2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpt1bQ924X2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpt1bQ924X2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpt1bQ924X2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms