Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc6Q924W5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smc6Q924W5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smc6Q924W5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smc6Q924W5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smc6Q924W5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms