Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prss28Q924N9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prss28Q924N9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prss28Q924N9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prss28Q924N9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss28Q924N9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms