Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC7

Nipal2, NIPA-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipal2Q91WC7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nipal2Q91WC7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nipal2Q91WC7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nipal2Q91WC7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nipal2Q91WC7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nipal2Q91WC7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nipal2Q91WC7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nipal2Q91WC7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nipal2Q91WC7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nipal2Q91WC7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nipal2Q91WC7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nipal2Q91WC7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nipal2Q91WC7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nipal2Q91WC7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nipal2Q91WC7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nipal2Q91WC7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nipal2Q91WC7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nipal2Q91WC7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nipal2Q91WC7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nipal2Q91WC7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nipal2Q91WC7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nipal2Q91WC7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nipal2Q91WC7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms