Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42ep1Q91W92 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42ep1Q91W92 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42ep1Q91W92 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42ep1Q91W92 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42ep1Q91W92 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42ep1Q91W92 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42ep1Q91W92 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42ep1Q91W92 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42ep1Q91W92 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42ep1Q91W92 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc42ep1Q91W92 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc42ep1Q91W92 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc42ep1Q91W92 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc42ep1Q91W92 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc42ep1Q91W92 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc42ep1Q91W92 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc42ep1Q91W92 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc42ep1Q91W92 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdc42ep1Q91W92 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc42ep1Q91W92 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc42ep1Q91W92 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42ep1Q91W92 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms