Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col26a1Q91VF6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col26a1Q91VF6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col26a1Q91VF6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Col26a1Q91VF6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col26a1Q91VF6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col26a1Q91VF6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col26a1Q91VF6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col26a1Q91VF6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col26a1Q91VF6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col26a1Q91VF6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col26a1Q91VF6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col26a1Q91VF6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col26a1Q91VF6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Col26a1Q91VF6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col26a1Q91VF6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col26a1Q91VF6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Col26a1Q91VF6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col26a1Q91VF6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col26a1Q91VF6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col26a1Q91VF6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col26a1Q91VF6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col26a1Q91VF6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col26a1Q91VF6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Col26a1Q91VF6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col26a1Q91VF6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col26a1Q91VF6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Col26a1Q91VF6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Col26a1Q91VF6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col26a1Q91VF6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col26a1Q91VF6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col26a1Q91VF6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col26a1Q91VF6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col26a1Q91VF6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col26a1Q91VF6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col26a1Q91VF6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col26a1Q91VF6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col26a1Q91VF6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col26a1Q91VF6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col26a1Q91VF6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col26a1Q91VF6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col26a1Q91VF6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col26a1Q91VF6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col26a1Q91VF6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col26a1Q91VF6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col26a1Q91VF6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col26a1Q91VF6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col26a1Q91VF6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Col26a1Q91VF6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col26a1Q91VF6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col26a1Q91VF6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col26a1Q91VF6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Col26a1Q91VF6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col26a1Q91VF6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col26a1Q91VF6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col26a1Q91VF6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col26a1Q91VF6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col26a1Q91VF6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col26a1Q91VF6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col26a1Q91VF6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col26a1Q91VF6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Col26a1Q91VF6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col26a1Q91VF6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col26a1Q91VF6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col26a1Q91VF6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col26a1Q91VF6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col26a1Q91VF6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Col26a1Q91VF6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col26a1Q91VF6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col26a1Q91VF6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col26a1Q91VF6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col26a1Q91VF6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col26a1Q91VF6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Col26a1Q91VF6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col26a1Q91VF6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col26a1Q91VF6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col26a1Q91VF6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms