Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc6a20aQ8VDB9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc6a20aQ8VDB9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc6a20aQ8VDB9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc6a20aQ8VDB9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc6a20aQ8VDB9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc6a20aQ8VDB9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc6a20aQ8VDB9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a20aQ8VDB9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc6a20aQ8VDB9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc6a20aQ8VDB9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc6a20aQ8VDB9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a20aQ8VDB9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a20aQ8VDB9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a20aQ8VDB9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a20aQ8VDB9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a20aQ8VDB9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a20aQ8VDB9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a20aQ8VDB9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a20aQ8VDB9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20aQ8VDB9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc6a20aQ8VDB9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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