Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clptm1Q8VBZ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clptm1Q8VBZ3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clptm1Q8VBZ3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clptm1Q8VBZ3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clptm1Q8VBZ3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clptm1Q8VBZ3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clptm1Q8VBZ3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clptm1Q8VBZ3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clptm1Q8VBZ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clptm1Q8VBZ3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clptm1Q8VBZ3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clptm1Q8VBZ3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clptm1Q8VBZ3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Clptm1Q8VBZ3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clptm1Q8VBZ3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clptm1Q8VBZ3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clptm1Q8VBZ3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Clptm1Q8VBZ3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clptm1Q8VBZ3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clptm1Q8VBZ3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clptm1Q8VBZ3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clptm1Q8VBZ3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clptm1Q8VBZ3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clptm1Q8VBZ3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clptm1Q8VBZ3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clptm1Q8VBZ3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clptm1Q8VBZ3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clptm1Q8VBZ3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clptm1Q8VBZ3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clptm1Q8VBZ3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Clptm1Q8VBZ3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Clptm1Q8VBZ3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clptm1Q8VBZ3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clptm1Q8VBZ3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clptm1Q8VBZ3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clptm1Q8VBZ3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clptm1Q8VBZ3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Clptm1Q8VBZ3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clptm1Q8VBZ3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clptm1Q8VBZ3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clptm1Q8VBZ3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clptm1Q8VBZ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clptm1Q8VBZ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clptm1Q8VBZ3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clptm1Q8VBZ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clptm1Q8VBZ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clptm1Q8VBZ3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clptm1Q8VBZ3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clptm1Q8VBZ3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clptm1Q8VBZ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clptm1Q8VBZ3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clptm1Q8VBZ3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clptm1Q8VBZ3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clptm1Q8VBZ3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clptm1Q8VBZ3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clptm1Q8VBZ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms