Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops8Q8VBV7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops8Q8VBV7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops8Q8VBV7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops8Q8VBV7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops8Q8VBV7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops8Q8VBV7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops8Q8VBV7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops8Q8VBV7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops8Q8VBV7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops8Q8VBV7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops8Q8VBV7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops8Q8VBV7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops8Q8VBV7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops8Q8VBV7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cops8Q8VBV7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cops8Q8VBV7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cops8Q8VBV7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops8Q8VBV7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops8Q8VBV7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops8Q8VBV7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops8Q8VBV7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops8Q8VBV7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops8Q8VBV7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops8Q8VBV7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops8Q8VBV7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops8Q8VBV7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops8Q8VBV7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops8Q8VBV7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops8Q8VBV7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops8Q8VBV7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops8Q8VBV7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops8Q8VBV7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops8Q8VBV7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops8Q8VBV7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cops8Q8VBV7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cops8Q8VBV7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops8Q8VBV7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops8Q8VBV7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops8Q8VBV7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops8Q8VBV7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops8Q8VBV7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops8Q8VBV7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops8Q8VBV7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops8Q8VBV7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops8Q8VBV7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops8Q8VBV7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops8Q8VBV7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms