Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Dnaaf4Q8R368 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Dnaaf4Q8R368 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Dnaaf4Q8R368 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dnaaf4Q8R368 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnaaf4Q8R368 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnaaf4Q8R368 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dnaaf4Q8R368 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dnaaf4Q8R368 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dnaaf4Q8R368 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dnaaf4Q8R368 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dnaaf4Q8R368 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnaaf4Q8R368 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnaaf4Q8R368 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnaaf4Q8R368 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnaaf4Q8R368 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dnaaf4Q8R368 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnaaf4Q8R368 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms