Protein–RNA interactions for Protein: Q8R322

Gle1, Nucleoporin GLE1, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gle1Q8R322 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gle1Q8R322 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gle1Q8R322 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gle1Q8R322 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gle1Q8R322 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms